Als uw behandelend arts vermoedt dat u een infectieziekte heeft zal deze afhankelijk van het verdachte micro-organismen diagnostiek inzetten en/of behandeling starten. In sommige gevallen (zoals bijvoorbeeld griep) gaat de ziekte vanzelf over en is een behandeling niet noodzakelijk. indien behandeling wel noodzakelijk is kan deze bestaan uit antibiotica (middelen die bacteriën doden) of antimycotica (middelen tegen gisten en schimmels). Soms is een lokale behandeling (oorduppels, oogdruppels of zalf) voldoende en in andere gevallen zal de huisarts systemische behandeling door middels van tabletten voorschrijven. Virussen, zoals bijvoorbeeld griep, zijn niet te behandelen met antibiotica.